홍정욱은 미국 바너드 대학교에서 미술사를 전공하고 뉴욕에서 큐레이터로 근무하던 손정희(1974년~)와 결혼해 1남 2녀를 두고 있다. 장인인 손명원은 현대미포조선, 쌍용자동차 사장을 지낸 전문 경영인으로 정치인 정몽준의 손윗 동서이다. 처의 증조부는 독립운동가이며 대한민국 임시 의정원 제2대 의장을 역임한 손정도 목사이고, 처의 친할아버지는 대한민국 해군 창군 주역이자 전 국방부 장관인 손원일 제독이다. 처의 외할아버지는 김동조 前 외무부 장관이다. 

홍정욱의 세 자녀는 미국에서 태어나거나 미국 시민권자인 손정희를 따라 국적법에 의해 미국과 한국 국적을 동시에 보유하게 되었다.

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이번에 밀반입한 딸은 미국가서 처벌받으면 되겠네 미국 법으로